《黑礁》

第1话 The Black Lagoon

日本，在旭日重工工作的普通员工冈岛绿郎。在向客户运送光盘的旅途中，被黑礁商会所捕捉，在不懂翻译的过程中被诱拐。他们的目标是绿郎带的光盘。在陌生地登陆的冈岛绿郎，和三个人一起被卷入了意外的袭击中…。

第2话 Mangrove Heaven

袭击黑礁商会的是被称为“战争屋”的佣兵们。冈岛绿郎得知自己是公司为了隐瞒事实而被公司抛弃的。被雇佣兵们乘坐的战斗直升机追击到海湾内，在被逼绝境之时洛克有了反击的想法。

第3话 Ring-Ding Ship Chase

在洛克击败了“战争屋”后，正式加入黑礁商会。然后，作为交涉的角色，在进行了暂时的工作的某一天，在罗亚纳普拉的街上，在办公室里享受了一点休息的拉拉斯商会，收到了领取横领品的委托。但是，委托是在俄罗斯黑手党身边工作的人的圈套……。

第4话 Die Rückkehr des Adlers

在战争结束前的印度洋，由联合军击沉的一艘轮船。在那个战舰内，留下了一幅“被布莱斯希尔德引导，十二名骑士”的绘画。黑礁商会的这次工作要打捞那幅画。于是开始进行回收工作的黑礁商会开始了打捞工作。

第5话 Eagle Hunting and Hunting Eagles

侵入轮船舰内的洛克和莱薇。另一方面，达奇询问了突然攻击的船舶的情况。他们的目的和他们一样，好像是沉没的轮船的探索，在潜水时进入了降温作业。这样下去会和舰内的黑礁商会碰面。

第6话 Moonlit Hunting Grounds

不審船から潜入した一団の襲撃を受け、レヴィたちは目的の絵を奪われてしまった。その絵を奪った彼らはナチスの遺産であるその絵を狙う、ネオナチの一団。相手の充実した装備に加え、依頼に提示された異常に高いギャラに不審を抱きながらも、ダッチとレヴィは絵を取り戻すべく、ネオナチの船へ襲撃を試みるが…。

第7话 Calm Down, Two Men

潜水艦での一件以来、ロックとレヴィの間は気まずいまま。険悪な雰囲気を漂わせたまま、二人はダッチの使いを黙々とこなす。最後に武器を受け取るべく訪れた教会では、ロックの機転で老獪なシスターを相手にした駆け引きに成功するも状況は変わらなかった。昼食の席で「もう謝らない」と宣言したロックにレヴィは…。

第8话 Rasta Blasta

武器の受け渡しを終えたラグーン号が受け取った荷物は、白人の少年だった。戸惑うロックに、荷物に余計な感情移入は必要ないと言うダッチ。少年のかわいげのなさにキレたレヴィに代わって見張りをすることになったロックは、激しい反発にさらされながらも、彼が南米十三家族、ラブレス家の次期当主であると確信して…。

第9话 Maid to Kill

イエローフフラッグに現れたのは、ラブレス家に仕えるハウスメイドであるロベルタだった。自分を囲むコロンビア・カルテルを相手に物怖じもせずに対峙したロベルタは、彼らと大銃撃戦を展開する。ロックたちはこの件から手を引くことを決意、少年をその場に置いて、銃撃戦のただなかから抜け出そうとするが…。

第10话 The Unstoppable Chambermaid

イエローフラッグから辛くも脱出したラグーン号の面々だが、ロベルタの追撃は続く。夜のロアナプラを舞台に、派手なカーチェイスを繰り広げるロックたち。ついにロベルタに捉えられたロックたちの車は、埠頭に積まれたコンテナの山に突っ込んでしまう。それでも起き上がってくるロベルタに万事休すと思われたその時…。

第11话 Lock'n Load Revolution

テロリストによって事務所を爆破された香港マフィアの張から、ラグーン商会に緊急の依頼が舞い込む。内容はアメリカに対するテロ計画書の運送。この仕事には慎重を期して、それぞれに目的地が設定された五つのチームが用意されていた。依頼の最中、張の事務所に続き、ラグーン商会も容赦のない襲撃を受けるが…。

第12话 Guerrillas in the Jungle

陽動のため、二手に分かれたラグーン号の面々。レヴィとロックは無事に逃し屋との待ち合わせ場所にたどり着くが、先回りしていたテロリストにロックが捕えられてしまう。逃がし屋に偽装して彼らを待ち受けていたのは、テロリストの中にいたタケナカだった。アジトで尋問を受けるロックにタケナカは自分の過去を語り…。

SP1 - BLACK LAGOON 高校編

SP2 - BLACK LAGOON 魔法少女編

SP3 - BLACK LAGOON バラライカの憂鬱

SP4 - BLACK LAGOON 男の子女の子編

SP5 - BLACK LAGOON 納涼 怖い話編

SP6 - BLACK LAGOON ビバ!ヤング編

SP7 - BLACK LAGOON めざせお笑いグランプリ